Search for biomarkers for early identification of sex and population structure of Dissostichus eleginoides.
Una de las actividades más relevantes que tiene Chile es la acuicultura. Focalizado principalmente en salmónidos. Por lo que, en los últimos años, el país ha puesto en marcha un programa de diversificación acuícola de especies marinas como Dissostichus eleginoides (Patagonian toothfish o bacalao de profundidad D. eleginoides es un recurso con un elevado valor económico, nutricional y con una elevada demanda tanto en mercados nacionales como internacionales. La sobrepesca de este recurso ha dejado como consecuencia que se encuentra catalogado como “Agotado y en fuerte sobrepesca” por la Subsecretaria de Pesca y Acuicultura de Chile. Este pez se distribuye por todo el territorio marítimo chileno, y es de gran tamaño y con una vida media de 50 años, con una madurez sexual de alrededor de 10 años. Este lento crecimiento sexual, dificulta la separación temprana de machos y hembras que mejoran el manejo de la especie en términos productivos. La búsqueda de biomarcadores específicos de sexo es un recurso importante si se plantea generar una producción sostenible en el tiempo de D. eleginoides. Por otro lado, los estudios genéticos de población pueden generar información relevante y necesaria tales como conexión de poblaciones, diseño de unidades de administración y diversidad genética. Información relevante para poder evitar el inbreeding, mejorando la producción. Se logro determinar un SNP (single nucleotide polymorphism) para determinar de manera temprana el sexo y obtuvieron 11 SSR (simple sequence repeat) para análisis de estructura poblacional mediante RADseq y secuenciación mediante Illumina MiSeq Nano platform respectivamente.
Search for biomarkers for early identification of sex and population structure of Dissostichus eleginoides.
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DOI: 10.22533/at.ed.6242013117
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Palavras-chave: Biomarcador, SSR, SNPs, Dissostichus eleginoides
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Keywords: Biomarker, SSR, SNPs, Dissostichues eleginoides
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Abstract:
One of the most relevant activities that Chile has is aquaculture. Mainly focused on salmonids. Therefore, in recent years, the country has launched an aquaculture diversification program for marine species such as Dissostichus eleginoides (Patagonian toothfish). D. eleginoides is a resource with high economic and nutritional value and with high Demand both in national and international markets. The overfishing of this resource has resulted in it being classified as "Exhausted and heavily overfished" by the Chilean Undersecretary of Fisheries and Aquaculture. This fish is distributed throughout the Chilean maritime territory, and it is large in size and with a half-life of 50 years, with a sexual maturity of around 10. This slow sexual growth makes the early separation of males and females difficult, improving the management of the species in productive terms. Search of specific sex biomarkers is an important resource if it is proposed to generate a sustainable production over time of D. eleginoides. On the other hand, genetic studies of the population can generate relevant and necessary information such as population connection, design of management units and genetic diversity. Relevant information to avoid inbreeding, improving production. It was possible to determine a SNP (single nucleotide polymorphism) to determine the sex early and they obtained 11 SSRs (single sequence repeat) for population structure analysis by RADseq and sequencing by Illumina MiSeq Nano platform respectively.
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Número de páginas: 15
- Killen Garcia
- Scarleth Bravo
- Francisco Leiva
- Rodrigo Vidal
- Jorge Hantar Touma Lazo
