QUAIS PERCEPÇÕES O DNA AMBIENTAL PODE FONERCER PARA AVALIAÇÃO ECOLÓGICA DE RESERVATÓRIOS NO SEMIÁRIDO BRASILEIRO?
O DNA ambiental (eDNA) compreende o DNA total extraído de amostras ambientais como solo, água ou ar, e representa uma ferramenta de alto potencial na avaliação da biodiversidade presente em diferentes ecossistemas. Os reservatórios são ecossistemas artificiais de água doce que fornecem diversos serviços: piscicultura, irrigação, abastecimento humano, controle microclimático e conservação da biodiversidade. Entretanto, fatores naturais e/ou antrópicos resultam em degradação desses ecossistemas aquáticos, caracterizada por eutrofização. Portanto, torna-se imprescindível acompanhar o estado de saúde desses ambientes. O monitoramento permanente desses ecossistemas é realizado através da análise da dinâmica de fatores abióticos ou bióticos, baseado na diferenciação morfológica ou funcional dos grupos. No entanto, esse é um método demorado e dispendioso, além de ser limitado pelo conhecimento do operador. Abordagens alternativas baseadas em eDNA vêm sendo utilizadas, por serem mais rápidas e econômicas, além de auxiliarem na resolução de conflitos taxonômicos, em grupos que nos estágios de desenvolvimento apresentam estruturas diferenciais de difícil visualização. O objetivo deste trabalho foi analisar o estado atual de conhecimento sobre a utilização do eDNA em estudos de monitoramento e determinação do estado ecológico de ecossistemas aquáticos, visando aplicação no Semiárido. Esta revisão discute eDNA barcoding e metabarcoding como métodos para biomonitoramento de espécies específicas ou de toda a composição taxonômica, respectivamente, presente em amostras de água. Pelo método de barcoding, trechos curtos de lócus genéticos padrões para identificação de espécies são amplificados usando uma amostra de eDNA como molde, cujos amplicons são sequenciados. Já para a identificação de organismos conhecidos e desconhecidos dentro de espécies ou das diferentes espécies presentes na amostra se realiza o sequenciamento global do eDNA. Devido a possibilidade de revelar toda a composição taxonômica de uma amostra ambiental, esses estudos de metagenômica trazem informações relevantes sobre a abundância relativa da microbiota, fauna e flora em uma única amostra.
QUAIS PERCEPÇÕES O DNA AMBIENTAL PODE FONERCER PARA AVALIAÇÃO ECOLÓGICA DE RESERVATÓRIOS NO SEMIÁRIDO BRASILEIRO?
-
DOI: https://doi.org/10.22533/at.ed.58321200713
-
Palavras-chave: Marcadores ecológicos; avaliação ambiental; barcoding de eDNA; metagenômica de eDNA; identificação de espécies
-
Keywords: Ecological markers; environmental assessment; eDNA barcoding; eDNA metagenomic; especies identification
-
Abstract:
The environmental DNA (eDNA) comprises the total DNA extracted from environmental samples such as soil, water or air, and represents a high potential tool for assessing the biodiversity present in different ecosystems. Reservoirs are artificial freshwater ecosystems that provide multiple services, especially during long periods of drought, such as fish farming, irrigation, human supply, microclimate control and conservation of biodiversity. However, natural and/or anthropic factors result in the degradation of these aquatic ecosystems, often due to eutrophication. Hence, it is essential to monitor the health status of these environments. The permanent monitoring of these ecosystems is performed by analyzing the dynamics of abiotic or biotic factors, based on the morphological or functional differentiation of the groups. However, this is a time-consuming expensive method and limited by the operator's knowledge. Alternative approaches based on eDNA have been used, since they are faster and more economical, in addition to assisting in the resolution of taxonomic conflicts, in groups, in which in the stages of development they present differential structures that are difficult to visualize. The objective of this study was to survey the use of eDNA as a tool for environmental assessment, for application in the semiarid region. This review discusses eDNA barcoding and metabarcoding as methods for biomonitoring of specific species or the entire taxonomic composition, respectively, present in water samples. By the barcoding method, short stretches of standard genetic locus for species identification are amplified using an eDNA sample as a template, whose amplicons are sequenced. For the identification of known and unknown organisms within species or the different species present in the sample, the global sequencing of the eDNA is performed. Due to the possibility of revealing the entire taxonomic composition of an environmental sample, these metagenomics studies provide relevant information on the relative abundance of microbiota, flora and fauna in a single sample.
-
Número de páginas: 15
- Betsy Dantas de Medeiros
- Magnólia de Araújo Campos Pfenning
- Maria João Feio
- Daniele Jovem-Azevêdo
