PREDIÇÃO DE SMALL NUCLEOLAR HOST GENE (SNHG): UMA ANÁLISE IN SILICO
Os genes hospedeiros de RNA nucleolar pequeno (SNHGs) desempenham diversas atividades e mecanismo de ação em vários tipos de câncer promovendo proliferação, apoptose, invasão e migração. Neste contexto, buscou-se fazer uma caracterização dos SNHGs (Host Gene de snoRNAs) por meio de dados provenientes de databases públicos e on-line a fim de predizer o papel destas biomoléculas no câncer. Para a obtenção dos dados foram feitas buscas dos SNHGs por meio da caracterização dos snoRNAs, utilizando as ferramentas RNA central, SnoDB esnoRNA Atlas. Foi possível observar 58 snoRNAs através do RNA central, sendo 51 C/D Box, 6 H/ ACA Box e 1 small Cajal Body. Quanto à expressão dos SNHGs, foram feitas buscas com carcinoma de células escamosas de cabeça e pescoço e câncer cervical. Além disso, foi feita a busca de microRNAs regulados por essas biomoléculas. Foi possível observar que o SNHG1 apresenta maior nível de expressão quando comparado com o tumor e amostra normal, enquanto o menor é o SNHG3 em câncer de cabeça e pescoço, já em câncer cervical, o SNHG3 apresentou maior expressão e o SNHG22 menor expressão. Através da função dos SNHGs foi possível observar que estas biomoléculas interagem com microRNAs. Mediante aos resultados obtidos foi possível observar que a caracterização in silico destas biomoléculas trouxe informações sobre a função, e potencialidade como biomarcadores de prognóstico.
PREDIÇÃO DE SMALL NUCLEOLAR HOST GENE (SNHG): UMA ANÁLISE IN SILICO
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DOI: 10.22533/at.ed.1382327071
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Palavras-chave: Biomarcadores, Oncogênese, LncRNAs, microRNAs, snoRNAs.
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Keywords: Biomarkers, Oncogenesis, LncRNAs, microRNAs, snoRNAs.
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Abstract:
Host small nucleolar RNA genes (SNHGs) play diverse activities and mechanism of action in several types of cancer promoting proliferation, apoptosis, invasion and migration. In this context, we sought to characterize SNHGs (Host Gene of snoRNAs) using data from public and online databases in order to predict the role of these biomolecules in cancer. To obtain the data, SNHGs were searched by snoRNAs characterization using RNA central, SnoDB and snoRNA Atlas tools. It was possible to observe 58 snoRNAs through RNA central, being 51 C/D Box, 6 H/ ACA Box and 1 small Cajal Body. As for the expression of SNHGs, searches were performed with head and neck squamous cell carcinoma and cervical cancer. In addition, a search for microRNAs regulated by these biomolecules was performed. It was possible to observe that SNHG1 shows higher expression level when compared with tumor and normal sample, while the lowest is SNHG3 in head and neck cancer, already in cervical cancer, SNHG3 showed higher expression and SNHG22 lower expression. Through the function of SNHGs it was possible to observe that these biomolecules interact with microRNAs. Through the obtained results it was possible to observe that the in silico characterization of these biomolecules brought information about the function, and potentiality as prognostic biomarkers.
- THAÍS DA CONCEIÇÃO SILVA
- ANA GABRIELLY DE MELO MATOS
- LARISSA RODRIGUES DE SOUSA
- ELDEVAN DA SILVA BARBOSA
- EMANOEL DA LUZ SILVA SOUSA
- MAIZA DE SOUZA PALMEIRA
- ALANIA FRANK MENDONÇA
- ELIEL BARBOSA TEIXEIRA
- SUSANNE SUELY SANTOS DA FONSECA
- ANTONIA CLAUDIA DA CONCEIÇÃO PALMEIRA
- IGOR DA CRUZ PINHEIRO
- JAQUELINE DINIZ PINHO
