En los huertos, las micorrizas desempeñan un papel crucial para el establecimiento y equilibrio de los ecosistemas, ademas, contribuyen en el mantenimiento de la estabilidad de los agregados del suelo a través de la producción de la enzima glomalina. El objetivo de este estudio fue caracterizar la diversidad morfológica de esporas de HMA y las fracciones de glomalina en el Huerto Agroecológico Facultad de Biología UV, Xalapa. Para ello, se tomaron muestras de suelo de cinco áreas (cultivo, medicinales, milpa, pasillos y área educativa), se realizó el aislamiento e identificación de los morfotipos de HMA y se cuantificaron las fracciones de glomalina. Como resultados, se detectaron cinco morfotipos, ubicados en tres géneros (Glomus, Acaulospora y Gigaspora); dos morfotipos de Glomus, dos de Acaulospora y uno de Gigaspora. El género Glomus fue el de mayor presencia en las cinco áreas del HAFBX. Los contenidos de glomalina total (GT) y fácilmente extraible (GFE) fueron más altos en las camas de cultivo y se relacionaron significativamente con el número de esporas de HMA. Por otro lado, la baja conductividad eléctrica del suelo favoreció la producción de glomalina total (GT).