IDENTIFICAÇÃO E CARACTERIZAÇÃO MOLECULAR DE PEIXES DA APA DO INHAMUM, LESTE MARANHENSE, BRASIL
O DNA barcode vem sendo utilizado como método auxiliar na identificação de espécies. Além do gene COI, o gene mitocondrial rRNA16S, também tem se revelado como um bom marcador na diferenciação de peixes. Neste trabalho, objetivou-se realizar a identificação e caracterização genética das espécies de peixes da Área de Proteção Ambiental (APA) Municipal do Inhamum, a partir de sequências dos genes COI e rRNA 16S. Para a coleta foram utilizados vários apetrechos de pesca e os espécimes coletados foram identificados com auxílio de literatura específica e confirmados por especialista. O DNA dos espécimes foi extraído usando o kit da Promega e os fragmentos dos genes mitocondriais COI e rRNA 16S foram amplificados através da técnica de PCR. Os produtos das PCRs foram purificados e sequenciados em sequenciador automático de DNA. Foram coletados 440 espécimes dos quais obteve-se 72 sequências do gene COI e 74 do gene rRNA 16S identificadas em seis ordens, 10 famílias e 15 espécies. Dentre essas espécies, Megalechis thoracata caracteriza um novo registro para a bacia do rio Itapecuru. A árvore filogenética para o gene COI evidenciou 16 clados coespecificos fortemente suportados com 100% de bootstrap. A reconstrução filogenética gerada a partir do gene rRNA 16S, evidenciou a ocorrência de 15 clados. A maioria dos clados correspondem a uma única espécie, entretanto, as sequências de Gymnotus carapo e Hemigrammus guyanensis formaram cada uma, dois clados fortemente agrupados com 99% de bootstrap. Portanto, esse trabalho representa, além da caracterização genética dos peixes dessa APA, uma extensão a extensão de distribuição de M. thoracata, pois agora sabe-se de sua ocorrência na bacia do rio Itapecuru.
IDENTIFICAÇÃO E CARACTERIZAÇÃO MOLECULAR DE PEIXES DA APA DO INHAMUM, LESTE MARANHENSE, BRASIL
-
DOI: 10.22533/at.ed.21419210614
-
Palavras-chave: DNA mitocondrial, COI, rRNA 16S, Megalechis thoracata
-
Keywords: Mitochondrial DNA, COI, rRNA 16S, Megalechis thoracata
-
Abstract:
DNA barcode has been used as an auxiliary method to identify species. In
Conceitos Básicos da Genética Capítulo 14 152
addition to the COI gene, the mitochondrial gene rRNA16S, has also been shown to be a good marker in fish differentiation. The objective of this work was to identify and characterize the fish species of the Inhamum Municipal Environmental Protection Area (APA), based on sequences of the COI and 16S rRNA genes. For the collection, several fishing tools were used and the specimens collected were identified with the aid of specific literature and confirmed by specialists. The DNA of the specimens was extracted using the Promega kit and the fragments of the mitochondrial genes COI and 16S rRNA were amplified by the PCR technique. PCR products were purified and sequenced in an automated DNA sequencer. A total of 440 specimens were collected from which 72 sequences of the COI gene and 74 of the 16S rRNA gene were identified in six orders, 10 families and 15 species. Among these species, Megalechis thoracata characterizes a new record for the Itapecuru river basin. The phylogenetic tree for the COI gene evidenced 16 heavily supported co-specific clades with 100% bootstrap. The phylogenetic reconstruction generated from the 16S rRNA gene, evidenced the occurrence of 15 clades. Most clades correspond to a single species, however, the sequences of G. carapo and Hemigrammus guyanensis formed each, two clades strongly grouped with 99% bootstrap. Therefore, this work represents, in addition to the genetic characterization of the fish in this APA, an extension of the distribution of M. thoracata, since it is now known to occur in the Itapecuru river basin.
-
Número de páginas: 15
- Renato Corrêia Lima
- Marcelo Silva de Almeida
- Maria Claudene Barros
- Elmary da Costa Fraga
- RENATO CORREIA LIMA
