Desenvolvimento de Framework para Criação de Modelos Computacionais de Célula Completa
Propostas para a criação modelos
computacionais de células completas que
levem em consideração a função dos genes são
relativamente recentes. Tais modelos buscam
representar todos os processos bioquímicos
intracelulares de maneira a fornecer uma maneira
rápida e eficiente de obter resultados simulados
confiáveis e comparáveis aos obtidos com
métodos in vitro ou in vivo. O desenvolvimento
desses modelos tem ajudado a consolidar o
conhecimento atual da biologia, e fornecido
subsídios para avanços científicos mais rápidos
em áreas como a medicina e a bioengenharia.
No entanto, a alta complexidade envolvida em
sua construção é uma das principais barreiras
para sua popularização. Visando simplificar
e acelerar o processo de produção de novos
modelos, nos propomos a criar um framework
que represente a formalização da metodologia
seguida pelos principais modelos atuais, e guie
o usuário no processo de criação e simulação
dos modelos.
Desenvolvimento de Framework para Criação de Modelos Computacionais de Célula Completa
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DOI: 10.22533/at.ed.1381912026
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Palavras-chave: Desenvolvimento de software, Modelagem computacional, Modelos de célula completa, Ferramenta computacional.
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Keywords: Software development, Computer modelling, Whole-cell models, Computational tool.
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Abstract:
Attempts to create whole-cell
computational models that take into consideration
the function of genes are relatively recent. Such
models aim to represent all the intracellular
biochemical processes in a way that allows fast
and efficient achievement of fast and reliable
results, comparable to the ones obtained from
in vitro or in vivo experiments. The development
of these models has been important not only to
consolidate the current knowledge of Biology,
but also as a way to provide subsidy for faster
scientific advancements in areas such as
medicine and bioengineering. However, the
high complexity involved in their construction is
one of the main barriers to their popularization.
To simplify and accelerate the process of model
building, we are creating a framework as a tool
that guides the user through the methodology
used to create and simulate the main current
whole-cell models.
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Número de páginas: 15
- Paulo Eduardo Ambrósio
- Frederico Chaves Carvalho