DESENHO DE PRIMERS PARA ANALISE DO POLIMORFISMO DO GENE MITOCONDRIAL MT-ATP SUBUNIDADE 6 (mtATP6) EM PEIXE-REI.
O seguinte trabalho teve como
objetivo a construção de primers visando
a identificação do polimorfismo do gene
mitocondrial ATP6 nas diferentes espécies de
peixe-rei do gênero Odontesthes. A construção
dos primers foi realizada utilizando uma contig
construída a partir de uma biblioteca de DNA
da espécie Odontesthes humensis, contra o
gene mtATP6 do gênero Odontesthes sp. O
desenho dos primers foi realizado com o auxílio
do programa Primer3, sendo estabelecido que
os primers devessem apresentar um tamanho
entre 20 a 30 pares de bases, temperatura de
anelamento entre 50 a 60°C com diferença de
no máximo 3°C e concentração de guanina
e citosina entre 40 a 60%. Em simulações in
silico, o par de primer desenhado demostrouse
eficaz para detectar a maior proporção do
polimorfismo do gene mtATP6 em diferentes
espécies de peixe-rei do gênero Odontesthes,
tornando uma ferramenta potencial para análise
da diversidade genética.
DESENHO DE PRIMERS PARA ANALISE DO POLIMORFISMO DO GENE MITOCONDRIAL MT-ATP SUBUNIDADE 6 (mtATP6) EM PEIXE-REI.
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DOI: 10.22533/at.ed.60919150417
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Palavras-chave: Odontesthes, DNA mitocondrial, diversidade genética.
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Keywords: Odontesthes, mitochondrial DNA, genetic diversity.
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Abstract:
The objective of this work was
to construct primers aiming at identifying the
polymorphism of the mitochondrial ATP6 gene in the different Peixe-rei species of
the genus Odontesthes. Construction of the primers was performed using a contig
constructed from a DNA library of the Odontesthes humensis species against the
mtATP6 gene of the genus Odontesthes sp. The design of the primers was performed
with the aid of the Primer3 program, and it was established that the primers should
have a size between 20 and 30 base pairs, annealing temperature between 50 and
60° C with a difference of maximum 3 ° C and concentration of guanine and cytosine
between 40 and 60%. In silico simulations, the primer pair was shown to be effective
in detecting mtATP6 gene polymorphism in different Peixe-Rei species of the genus
Odontesthes, making it a potential tool for genetic diversity analysis.
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Número de páginas: 15
- Daniel Ângelo Sganzerla Graichen
- Vanessa Seidel
- Lusma Gadea de Mello
- Gadriéli Cristina Gheno
- Mateus Tremea
- Alexandra Möller Alves
- Suellen Susin Gazzola
- Rafael Aldrighi Tavares
- Gabrielle Silveira Waishaupt
