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DESCRIÇÃO DE GENES FLANQUEADOS POR MICROSSÁTELITES NA CULTURA DO CAJUZINHO-DO-CERRADO (Anacardium humile St. Hill.)

Com alta variabilidade e sendo nativo do cerrado brasileiro, o cajuzinho-do-cerrado (Anacardium humile St. Hill.) possui uma alta aceitabilidade pelas comunidades locais, em virtude dos frutos serem atraentes e com características peculiares, como sabor único, potencial no uso na indústria frutífera e uso sustentável por produtores. Assim, o uso da biotecnologia pode ser de grande valia, uma vez que, para este gênero há poucas informações. Em particular, o estudo e descrição de genes da cultura é fundamental para que se possa fazer estratégias para a conservação e melhoramento da espécie. O objetivo deste trabalho foi identificar e descrever genes flanqueados por oito marcadores microssatélites na cultura do cajuzinho-do-cerrado (Anacardium humile St. Hill.), utilizando o genoma de Anacardium occidentale (cajueiro comum) do banco de dados Phytozome. Os resultados revelam que todos os marcadores flanquearam ou estavam próximo de genes, sendo possível identificar as informações de sequência genômica (SG), sequência do transcrito (ST), sequência CDS ou Coding DNA Sequencing (SCDS) e sequência do peptídeo (SP). Além disso, foram obtidas todas as anotações funcionais, exceto para o gene Anaoc.0935s0002 flanqueado pelo marcador mAoR6. Ainda, pode-se destacar a função associada do gene Anaoc.0015s0338 relacionada ao domínio de proteína quinase, pois desempenha papel importante na expressão de respostas aos estresses ambientais, como frio ou seca. A utilização do banco de dados genômicos do Phytozome é eficiente no flanqueamento dos genes de Anacardium humile St. Hill. Todos os marcadores. Os oito marcadores microssatélites utilizados flanquearam ou estão próximo a genes, onde apenas o marcador mAoR6 não apresentou anotação associadas. Dessa forma os resultados são promissores quando relacionados as novas perspectivas para melhoramento em cajuzinho-do-cerrado.
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DESCRIÇÃO DE GENES FLANQUEADOS POR MICROSSÁTELITES NA CULTURA DO CAJUZINHO-DO-CERRADO (Anacardium humile St. Hill.)

  • DOI: 10.22533/at.ed.1222323106

  • Palavras-chave: cajuzinho do cerrado, microssatélites, marcadores moleculares.

  • Keywords: cajuzinho do cerrado, microsatellites, molecular markers

  • Abstract: With high variability and being native to the Brazilian cerrado, the cajuzinho-do-cerrado (Anacardium humile St. Hill.) has a high acceptability by local communities, because the fruits are attractive and have peculiar characteristics, such as unique flavor, potential use in the fruit industry and sustainable use by producers. Thus, the use of biotechnology can be of great value, since for this genus there is little information. In particular, the study and description of the culture's genes is fundamental to make strategies for the conservation and improvement of the species. The objective of this work was to identify and describe genes flanked by eight microsatellite markers in the cajuzinho-do-cerrado (Anacardium humile St. Hill.) crop, using the genome of Anacardium occidentale (common cashew tree) from the Phytozome database. The results prove that all markers flanked or were close to genes, making it possible to identify the genomic sequence information (SG), transcript sequence (ST), CDS sequence or Coding DNA Sequencing (SCDS) and peptide sequence (SP). In addition, all annotations except for the Anaoc.0935s0002 gene flanked by the mAoR6 marker were started. Furthermore, the associated function of the Anaoc.0015s0338 gene related to the protein kinase domain can be highlighted, as it played an important role in the expression of responses to environmental stresses, such as cold or drought. The use of the Phytozome genomic database is efficient in flanking the genes of Anacardium humile St. Hill. All bookmarks. The eight microsatellite markers used flanked or are close to genes, where only the mAoR6 marker did not show associated annotation. Thus, the results are promising when related to new perspectives for improvement in cajuzinho-do-cerrado.

  • Bárbara Vitória Gomes de Brito
  • Leonardo França da Silva
  • Victor Crespo de Oliveira
  • Anarlete Ursulino Alves
  • Fabrício Custódio de Moura Gonçalves
  • Francisco de Assis Gomes Junior
  • Ariadna Faria Vieira
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