O desenvolvimento da cidade de Cariacica tem se dado no sentido da urbanização, trazendo impactos tanto positivos, quanto negativos, principalmente aos recursos hídricos, refletido em falta de saneamento básico devido a ações antrópicas praticadas próximas ao curso d'água. O objetivo principal da pesquisa foi analisar microbiologicamente a qualidade superficial da água do rio Bubu, através da utilização de tubos múltiplos, para evidenciar a ocorrência de coliformes totais e termotolerantes, contabilizando espécies de microrganismos heterotróficos encontrados nas águas coletadas. Dessa forma, as amostras para realização da pesquisa foram duas, uma na zona rural (Bubu) e a outra em zona urbanizada (Porto) na região de Cariacica, um município do estado do Espírito Santo (ES). No estudo, as análises com tubos múltiplos, foram realizadas com algumas diluições do material biológico para semeadura e identificação das bactérias e coliformes detectados. Além disso, um outro procedimento metodológico utilizado, foi contagem dos microrganismos heterotróficos, realizado a partir do espalhamento em placas de petri, em meio de cultura ágar nutriente e ágar sabouraud, o que permitiu o crescimento bacteriano no interior do ágar, facilitando a contagem das colônias de microrganismos. Por fim, entende-se que a amostra biológica coletada durante a atual pesquisa na zona urbana apresentou maior número de bactérias e fungos comparado a zona rural, o que demonstrou o impasse envolvendo saúde pública em função do despejo de esgoto devido a falta de saneamento básico da região, ao qual o rio perpassa.