Análise in silico de Inibidores da Enzima 6-Fosfogluconolactonase do parasita Leishmania sp. usando Docking Molecular e Simulações de Dinâmica Molecular
Leishmaniose é uma infecção parasitária e endêmica que acomete milhões de pessoas ao redor do mundo. Diversos compostos são utilizados para tratar essa doença, porém não existe um tratamento ideal para essa enfermidade, devido à alta toxicidade e baixa eficácia dos medicamentos. As enzimas responsáveis pelo metabolismo energético de tripanossomatídeos são alvos estratégicos no planejamento de fármacos, sendo de grande importância para a manutenção da vida do parasito. Neste trabalho, foi realizado um estudo para identificar o sítio ativo da enzima 6-Fosfoglucolactonase da espécie Leishmania (Viannia) braziliensis, com a aplicação de técnicas de modelagem molecular, como docagem e dinâmica molecular QM/MM. O estudo foi desenvolvido com o modelo cristalográfico da enzima 6-Fosfoglucolactonase (6-FGL) obtida do Protein Data Bank e os compostos δ-6-fosfoglucolactona e ácido 6-fosfoglucônico, respectivamente, substrato e produto nativos da enzima. A comparação da sequência de aminoácidos da enzima (6-FGL) do Leishmania (V.) braziliensis com do T. brucei apontou a conservação dos resíduos presentes no sítio de ligação da enzima do T. brucei do Leishmania. Os modos de ligação preditos pela docagem molecular mostraram a formação de interações atrativas importantes dos dois compostos, primordialmente, com os resíduos Arg77, His168 e Arg201.
Análise in silico de Inibidores da Enzima 6-Fosfogluconolactonase do parasita Leishmania sp. usando Docking Molecular e Simulações de Dinâmica Molecular
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Palavras-chave: Inibidores, 6-FGL, Leishmania sp., docking, dinâmica molecular
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Keywords: Inhibitors, 6-FGL, Leishmania sp., docking, molecular dynamics
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Abstract:
Leishmaniasis is a parasitic and endemic infection that affects millions of people around the world. Several compounds are used to treat this disease, but there is no ideal treatment for this disease, due to the high toxicity and low efficacy of medications. Enzymes responsible for trypanosomal energy metabolism are strategic targets in drug planning and are of great importance for the maintenance of parasite life. In this work, a study was conducted to identify the active site of the enzyme 6-Phosphoglucolactonase of the species Leishmania (Viannia) braziliensis, with the application of molecular modeling techniques such as docking and molecular dynamics QM / MM. The study was developed with the crystallographic model of the enzyme 6-Phosphoglucolactonase (6-FGL) obtained from Protein Data Bank and the compounds δ-6-phosphoglucolactone and 6-phosphogluconic acid, respectively, native substrate and product of the enzyme. Comparison of the amino acid sequence of Leishmania (V.) braziliensis (6-FGL) enzyme with T. brucei showed the conservation of residues at the Leishmania T. brucei enzyme binding site. The binding modes predicted by molecular docking showed the formation of important attractive interactions of the two compounds, primarily with the residues Arg77, His168 and Arg201.
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Número de páginas: 14
- Alan Sena Pinheiro
- Jorddy Neves da Cruz
- Renato Araújo da Costa
- Sebastião Gomes Silva
- João Augusto Pereira da Rocha
- Claudia Oliveira Sena
- Isaque Gemaque de Medeiros
- Jose de Arimateia Rodrigues do Rego
- Fábio Alberto de Molfetta
