Análise in silico da interação entre as proteínas p53 e CREBBP e sua relação com linfomas
CREBBP é uma proteína responsável por regular a expressão de genes através de vias de transdução de sinais, interferindo no crescimento e diferenciação celular, na estabilização de proteínas durante a transcrição, regulação de proteínas por acetilação e participação no remodelamento da cromatina. p53 é uma proteína associada a resposta ao estresse celular e apoptose frente a dano no DNA. Mutação no gene da CREBBP prejudica sua interação com p53 resultando em um efeito expressivo na desordem do sistema hematopoiético. Dessa forma, o objetivo do presente trabalho é estudar a interação entre a p53 e a CREBBP quando inserida uma mutação pontual em um hotspot, simulando um polimorfismo clínico ligado ao desenvolvimento de leucemias. Ferramentas de bioinformática foram usadas para predizer a interação proteína-proteína através do Cluspro. A análise da interface de interação e dos aminoácidos envolvidos nessa interação foi estabelecido através do programa PyMol. Os hotspots foram identificados através do servidor KFC. Ao comparar as regiões de hotspot com banco de dados de polimorfismos (dbSNP-NCBI) verificamos que resíduo de interleucina na posição 1084 é um polimorfismo clínico que pode sofrer mutação em frameshift (inserção um código de parada antes da porção terminal da proteína) sendo substituida por uma serina. O ensaio de mutagênese foi realizado pelo PyMol, alterando o resíduo hotspot de interleucina na posição 1084 pelo resíduo polimórfico de serina na mesma posição. Foi observado expressiva mudança estrutural e perda de parte da interface de interação entre as proteínas após a mutagênese. Em conclusão, a mutação foi capaz de desestruturar a conformação do complexo e a superfície de contato entre as proteínas, o que pode aumentar a susceptibilidade de desenvolvimento de leucemias.
Análise in silico da interação entre as proteínas p53 e CREBBP e sua relação com linfomas
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DOI: 10.22533/at.ed.40420240615
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Palavras-chave: hotspots, leucemia, mutação, p53, CREBBP
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Keywords: hotspots, leukemia, mutation, p53, CREBBP
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Abstract:
CREBBP is a protein responsible for regulating gene expression through signal transduction pathways, interfering with cell growth, differentiation, protein stabilization during transcription, regulation of proteins by acetylation and participation in chromatin remodeling. P53 is a protein associated with the response to cellular stress and apoptosis in the face of DNA damage. Mutation in the CREBBP gene impairs its interaction with p53 resulting in a significant effect on the disorder of the hematopoietic system. Thus, the objective of the present work is to study the interaction between p53 and CREBBP when a mutation is inserted in a hotspot, simulating a clinical polymorphism linked to the development of leukemia. Bioinformatics tools were used to predict protein-protein interaction through Cluspro. The analysis of the interaction interface and the amino acids involved in this interaction was established through the PyMol program. The hotspots were identified through the KFC server. When comparing the hotspot regions with a database of polymorphisms (dbSNP-NCBI), we verify that interleukin residue at position 1084 is a clinical polymorphism that can undergo frameshift mutation (insertion of a stop code before the terminal portion of the protein) being replaced for a serine. The mutagenesis assay was performed by PyMol, changing the hotspot residue of interleukin at position 1084 by the polymorphic residue of serine in the same position. Significant structural change and loss of part of the interaction interface between proteins was observed after mutagenesis. In conclusion, the mutation was able to disrupt the complex conformation and the contact surface between proteins, which can increase the susceptibility of leukemia development.
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Número de páginas: 9
- Marcos Antonio Batista de Carvalho Júnior
- Olívia Basso Rocha
- Livia do Carmo Silva
- Gabriela Danelli Rosa
- Jackeliny Garcia Costa
- Kleber Santiago Freitas
- Katheryne Lohany Barros Barbosa
