ANÁLISE IN SÍLICO DA EXPRESSÃO DE SNORNAs EM CÂNCER DE CABEÇA E PESCOÇO REVELA POTENCIAIS MARCADORES DE PIOR PROGNÓSTICO.
O câncer de cabeça e pescoço (CCP) é o sexto tipo de câncer mais comum no mundo, com aproximadamente 931 mil casos registrados anualmente. Mais de 50% dos pacientes são diagnosticados em estágio avançado da doença. Conhecidamente, o uso do tabaco, álcool e a infecção pelo HPV são importantes fatores de risco nesta neoplasia maligna. Além disso, causas adicionais como alterações genéticas e epigenéticas, precisam ser consideradas. Dentre os elementos epigenéticos, estão snoRNAs que têm sido o foco de muitos estudos nos últimos anos devido seu papel fundamental em muitas doenças humanas, inclusive no câncer. Diante disso, o presente estudo analisou através de ferramentas de bioinformática a expressão de snoRNAs em amostras de CCP, correlacionando os achados com os dados clínicos e histopatológicos dos pacientes. Para isso, foram utilizados dados oriundos do projeto TCGA. A caracterização dos snoRNAs quanto tipo, localização cromossômica e sequência genômica, foi realizada através das ferramentas RNA central, SnoDB e snoRNA Atlas e HGNC. Para a identificação da expressão dos snoRNAs e expressão de acordo com os fatores clínico-patológicos, foi utilizada a plataforma SNORic. Foram observados 346 snoRNAs com expressão diferencial entre tecido tumoral e não tumoral, 280 com expressão aumentada em tumor e 66 com expressão diminuída, sendo os mais expressos SNORD28 e SNORD7 e o menos expresso SNORD114-3. Quanto àqueles que foram associados com fatores de pior prognóstico, destacaram-se SNORD3C no grau histológico G3, e SCARNA15 no estágio patológico IV. De acordo com a pesquisa realizada na literatura, observou-se que 12 snoRNAs diferencialmente expressos em CCP, já foram abordados em outros tipos de cânceres, com destaque para o SNORD78. Desta forma, os dados apresentados elucidam a importância e influência da desregulação dessas biomoléculas, os quais podem ser possíveis ferramentas de grande relevância na predição do prognóstico.
ANÁLISE IN SÍLICO DA EXPRESSÃO DE SNORNAs EM CÂNCER DE CABEÇA E PESCOÇO REVELA POTENCIAIS MARCADORES DE PIOR PROGNÓSTICO.
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DOI: -
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Palavras-chave: Biomarcador, CEC cabeça e pescoço, snoRNAs.
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Keywords: Biomarkers, head and neckcancer, snoRNAs.
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Abstract:
Head and neck cancer (HNC) is the sixth most common type of cancer in the world, with approximately 931,000 cases registered annually. More than 50% of patients are diagnosed at an advanced stage of the disease. The use of tobacco, alcohol and HPV infection are known to be important risk factors for this malignant neoplasm. Furthermore, additional causes such as genetic and epigenetic alterations need to be considered. Among the epigenetic elements, there are snoRNAs that have been the focus of many studies in recent years due to their fundamental role in many human diseases, including cancer. Therefore, the present study analyzed, using bioinformatics tools, the expression of snoRNAs in HNC samples, correlating the findings with the patients' clinical and histopathological data. For this, data from the TCGA project were used. The characterization of snoRNAs in terms of type, chromosomal location and genomic sequence was performed using the central RNA, SnoDB and snoRNA Atlas and HGNC tools. To identify the expression of snoRNAs and expression according to clinicopathological factors, the SNORic platform was used. There were 346 snoRNAs with differential expression between tumor and non-tumor tissue, 280 with increased expression in tumor and 66 with decreased expression, the most expressed being SNORD28 and SNORD7 and the least expressed SNORD114-3. As for those that were associated with worse prognostic factors, SNORD3C stood out in histological grade G3, and SCARNA15 in pathological stage IV. According to research carried out in the literature, it was observed that 12 snoRNAs differentially expressed in CCP, have already been addressed in other types of cancer, with emphasis on SNORD78. Thus, the data presented elucidate the importance and influence of the deregulation of these biomolecules, which may be possible tools of great relevance in predicting the prognosis.
- ANA GABRIELLY DE MELO MATOS
- ELDEVAN DA SILVA BARBOSA
- Alania Frank Mendonça
- Ana Carla Silva Jansen
- Larissa Rodrigues de Sousa
- Antonia Claudia da Conceição Palmeira
- ELIEL BARBOSA TEIXEIRA
- MARCELLI GEISSE DE OLIVEIRA PRATA DA SILVA
- THAÍS DA CONCEIÇÃO SILVA
- WESLIANY EVERTON DUARTE
- ANTONIO AUGUSTO LIMA TEIXEIRA JÚNIOR
- Jaqueline Diniz Pinho
