ANÁLISE DE PLATAFORMAS E METODOLOGIAS PARA INTERAÇÃO PROTEINA-PROTEINA COMO FERRAMENTA IN SILICO
As interações proteínaproteína formam a base para a grande maioria
dos eventos celulares, incluindo a transdução
de sinais e regulação transcricional. Objetivo:
Consistiu em demonstrar a grande importância
das interações proteína-proteína (IPPs) que
são fundamentais em orquestrar os eventos
em uma célula. Métodos: Foi realizado um
levantamento bibliográfico, utilizando-se como
descritor: redes de interação, proteína-proteína,
bioinformática, utilizando o banco de dados
do pubmed, foram selecionados no total os
principais artigos e foi feita uma leitura analítica
para ordenar as informações e identificar
o objeto de estudo. Resultados: Tendo
em vista os diversos campos de aplicação
desenvolvemos a discussão embasada nas
principais plataformas e metodologias para
interação proteína-proteína como ferramenta
in silico entre elas o PDB, PROSITE, HPRD,
UniProtKB, Swiss-Prot, DIP, STRING, DOCK,
AutoDock, AutoDock Vina, MVD, FLEXX,
PharmDock, GOLD e GROMACS. Conclusão:
As metodologias e plataformas de Interação
Protéina-Protéina fornecem uma visão geral
simplificada de interações que ocorrem dentro
de uma célula.
ANÁLISE DE PLATAFORMAS E METODOLOGIAS PARA INTERAÇÃO PROTEINA-PROTEINA COMO FERRAMENTA IN SILICO
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DOI: 10.22533/at.ed.9341913065
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Palavras-chave: redes de interação; proteína; bioinformática; in silico.
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Keywords: interaction network; protein; bioinformatics; in silico.
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Abstract:
Protein-protein
interactions form the basis for the vast majority
of cellular events, including signal transduction
and transcriptional regulation. Objective:
Consisted in demonstrating the great importance
of protein-protein interactions (IPPs) that are
fundamental in orchestrating the events in a
cell. Methods: A bibliographical survey was
carried out, using as descriptor: interaction
networks, protein-protein, bioinformatics, usingthe pubmed database, the main articles were selected in total, and an analytical reading
was made to sort the information and identify the study object. Results: In view of the
different fields of application, we developed the discussion based on the main platforms
and methodologies for protein-protein interaction as an in silico tool including PDB,
PROSITE, HPRD, UniProtKB, Swiss-Prot, DIP, STRING, DOCK, AutoDock, AutoDock
Vina, MVD, FLEXX, PharmDock, GOLD and GROMACS. Conclusion: Protine-Protein
Interaction platforms and methodologies provide a simplified overview of interactions
that occur within a cell.
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Número de páginas: 15
- Rassan Dyego Romão Silva
- Benedito R. Da Silva Neto
- Bruno
