ANÁLISE
Durante a domesticação da cultura
do milho (Zea mays L.) pode ter ocorrido a
transferência de genes de resistência (R)
das espécies ancestrais e entre espécies
aparentadas. Os genes R podem ser
classificados em cinco classes, a CNL, TNL,
RLP, RLK e outros. O objetivo deste trabalho
foi identificar genes R comuns entre a espécie
Zea mays subsp. mays com Zea mays subsp.
parviglumis, Teosinto e Sorghum bicolor. As
sequências foram coletadas de bancos de dados
biológicos e a análise foi realizada com o auxílio
de ferramentas da bioinformática. No entanto,
não foi possível encontrar o transcriptoma
completo de todas as espécies, somente a
do Sorghum bicolor e Zea mays subsp. mays.
Para as outras duas espécies, foram utilizadas
informações parciais encontradas no GenBank
e no European Nucleotide Archive (ENA). Foi
possível a identificação de 1085 genes R comuns
entre o transcriptoma de Zea mays subsp.
mays e as sequências utilizadas de cada uma
das espécies. A comparação com o Sorghum
bicolor retornou 930 genes R divididos em todas
as classes. A comparação entre Zea mays
subsp. mays e Zea mays subsp. parviglumis,
possível ancestral do milho, totalizou 109
genes R comuns, enquanto que a análise com
o Teosinto retornou 44 genes R. Também foram
encontrados dois genes ortólogos entre todas
as espécies. Assim, os resultados obtidos neste
estudo poderão servir como base para futuros
estudos sobre o compartilhamento de genes de
resistência entre estas plantas.
ANÁLISE
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DOI: 10.22533/at.ed.5531927091
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Palavras-chave: Bioinformática, Genômica, Milho, Sorgo, Teosinto
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Keywords: Bioinformatics, Genomics, Corn, Sorghum, Teosinte
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Abstract:
During the domestication of the corn crop (Zea mays L.) resistance
genes (R) may have been transferred from the ancestral species and among related
species. R genes can be classified into five classes, CNL, TNL, RLP, RLK and others.
The objective of this work was to identify common R genes among the species
Zea mays subsp. mays with Zea mays subsp. parviglumis, Teosinte and Sorghum
bicolor. Sequences were collected from biological databases and the analysis was
performed using bioinformatics tools. However, it was not possible to find the complete
transcriptome of all species, only the Sorghum bicolor and Zea mays subsp. mays.
For the other two species, partial information found in GenBank and in the European
Nucleotide Archive (ENA) was used. It was possible to identify 1085 common R genes
between the transcriptome of Zea mays subsp. mays and the sequences used of each
of the species. The comparison with Sorghum bicolor returned 930 R genes divided
into all classes. The comparison between Zea mays subsp. mays and Zea mays
subsp. parviglumis, a possible corn ancestor, totaled 109 common R genes, whereas
the analysis with the Teosinte returned 44 R genes. Two orthologous genes were also
found among all species. Thus, the results obtained in this study may serve as a basis
for future studies on the sharing of resistance genes between these plants.
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Número de páginas: 15
- Ramir Bavaresco Junior
- Isabella da Cruz Franco
- Liliam Silvia Candido
- Rodrigo Matheus Pereira
- Ronaldo Omizolo de Souza
