A PRIMEIRA MODELAGEM MOLECULAR POR HOMOLOGIA DA PROTEÍNA VP4 DO VÍRUS CHANGUINOLA.
Os vírus são causadores de muitas doenças que assolaram a humanidade como a gripe espanhola, ebola, varíola e o sarampo. Dentre os diferentes grupos de vírus conhecidos estão as arboviroses, vírus transmitidos por artrópodes, sendo que no Brasil, já foram registrados 210 tipos diferentes de arbovírus e 34 são considerados patogênicos para o homem. Dentro desse grupo de vírus transmitidos por artrópodes, esta o Vírus Changuinola (CGLV). Esse grupo, atualmente, consiste de 12 sorotipos registrados no Catálogo Internacional de arbovírus, sendo o Vírus Irituia considerado o sorotipo protótipo do CGLV no Brasil. Em 1966, o VCGL foi isolado do sangue de um paciente, apresentando uma síndrome febril, na região de Bocas Del Toro, Panamá, único caso de doença humana relatado por este até o presente momento. Neste estudo nos relatamos a estrutura tridimensional da proteína VP4 do vírus Changuionola obtida por modelagem por homologia. Para construção do modelo de proteína foi utilizado o servidor SWISS MODEL.O modelo obtido foi validado através do servidor MolProbity onde a identidade com o molde (PDB ID: 2JH8) foi de 57,1% e o gráfico de Ramachandran mostra 91,8% dos resíduos em regiões estereoquimicamente favoráveis. A literatura considera a predição aceitável quando a mesma apresenta valores acima de 25% e 80%, respectivamente. Dessa maneira os resultados foram satisfatórios ao predizer a conformação da VP4 do CGLV desse modo gerando novas possibilidades no entendimento do comportamento desse vírus.
A PRIMEIRA MODELAGEM MOLECULAR POR HOMOLOGIA DA PROTEÍNA VP4 DO VÍRUS CHANGUINOLA.
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DOI: 10.22533/at.ed.36020210519
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Palavras-chave: Changuinola, Bluetongue, homologia, vírus, proteína.
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Keywords: Changuinola, bluetongue, homology, virus, protein.
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Abstract:
Viruses are simple organisms, but they are the cause of many diseases that have plagued mankind: the Spanish flu, Ebola virus, smallpox and measles. Among the different known virus groups are arboviruses, viruses transmitted by arthropods, and in Brazil, 210 different types of arbovirus have been registered and 34 are considered pathogenic for humans. Within this group of viruses transmitted by arthropods, there are some less known as Changuinola Virus (VCGL). This group currently consists of 12 serotypes registered in the International Arbovirus Catalog, the Irituia Virus considered the prototype serotype of the VCGL in Brazil. In 1966, VCGL was isolated from the blood of a human patient, presenting a febrile syndrome in the region of Bocas Del Toro, Panama, the only case of human disease reported by him to date. In this study, the sequence was obtained through pyro sequencing on the GSFlex 454 platform (Irituia serotype) for structural prediction through the SWISS MODEL server of the VCGL VP4 protein using as template the Bluetongue virus crystallographic model (PDB code: 2JH8). The obtained model was validated through the MolProbity server where the identity with the template was 57.1% and the Ramachandran graph shows 91.8% of the residues in stereochemically favorable regions. The literature considers the prediction to be acceptable when it presents values above 25% and 80%, respectively. In this way the results were satisfactory in predicting the conformation of VP4 of the VCGL thus generating new possibilities in the understanding of the behavior of this virus.
KEYWORDS:
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Número de páginas: 25
- BRUNO RAFAEL COSTA GUIMARÃES
- RAUL ALEXANDRE MACIEL CAMPOS
- JÂNIO DI PAULA CAVALLEIRO DE MACÊDO DOS SANTOS
- ADRIANO SANTOS DA ROCHA
- ALAN SENA PINHEIRO
- JORDDY NEVES CRUZ
- SANDRO PATROCA DA SILVA
- DAVI HENRIQUE TRINDADE AMADOR
- MIGUEL BRAGA
- RENATO ARAÚJO DA COSTA
- ELAINE CRISTINA MEDEIROS DA ROCHA
- João Augusto Pereira da Rocha
