4-TERPINEOL (-)4TRP COMO CANDIDATO A FÁRMACO PARA COVID-19
No final de 2019, um novo coronavírus (SARS-CoV-2) surgiu na China causando a maior pandemia viral dos últimos tempos. A inexistência de medicamentos específicos ocasionou uma incessante corrida para reposicionamento de fármacos no meio científico, para identificação de moléculas promissoras no tratamento da COVID-19. A NSP9 é uma replicase que está associada a replicação viral do SARS-CoV-2 e, portanto, representa um importante alvo para compostos inibidores. O 4-terpineol é um monoterpeno com inúmeras propriedades farmacológicas, entre elas atividade antimicrobiana e antiviral. O presente estudo adotou como objetivo fazer simulações de docking molecular entre a NSP9 e (-)-4-terpineol. As moléculas foram obtidas em base de dados públicas (PDB e ZINC). Foi utilizado o programa Autodocktools 1.5.6 para as simulações de docking, enquanto que as análises das interações e análise visual dos complexos foram realizados no programa DS-Discovery Studio. As energias de ligação obtidas tiveram valores negativos variando de -4.39 a -4.19 kcal/mol. O monoterpeno interagiu com 8 aminoácidos do sítio catalítico da enzima, sendo a maioria hidrofóbicos. Ocorreu a formação de uma ligação de hidrogênio entre a ARG40 e o grupamento hidroxila do ligante. As outras interações foram representadas por ligações do tipo alquil e pi-alquil promovidas por três aminoácidos e interações de van der Walls com outros quatro aminoácidos. Estes resultados indicam uma afinidade entre o ligante e o sítio ativo da enzima. O 4-terpineol é um candidato interessante para ensaios in vitro e in vivo visando determinar o potencial de inibição viral do SARS-CoV-2.
4-TERPINEOL (-)4TRP COMO CANDIDATO A FÁRMACO PARA COVID-19
-
DOI: 10.22533/at.ed.5562127095
-
Palavras-chave: Bioinformática estrutural e aplicada, Inibição viral, Modelagem molecular, Prospecção de fármacos
-
Keywords: Structural and Applied Bioinformatics, Viral Inhibition, Molecular Modeling, Drug Prospecting
-
Abstract:
In late 2019, a new coronavirus (SARS-CoV-2) emerged in China causing the biggest viral pandemic in recent times. The inexistence of specific medications led to an incessant race for the repositioning of drugs in the scientific world, to identify promising molecules for the treatment of COVID-19. NSP9 is a replicase that is associated with viral replication of SARS-CoV-2 and therefore represents an important target for inhibitor compounds. Terpinen-4-ol is a monoterpene with numerous pharmacological properties, including antimicrobial and antiviral activities. The present study aimed to perform molecular docking simulations between NSP9 and (-)-terpinen-4-ol. The molecules were obtained from a public database (PDB and ZINC). The Autodocktools 1.5.6 program was used for the docking simulations, while the interaction analysis and visual analysis of the complexes were performed using the DS-Discovery Studio program. The binding energies obtained had negative values ranging from -4.39 to -4.19 kcal/mol. The monoterpene interacted with 8 amino acids from the enzyme's catalytic site, most of which were hydrophobic. A hydrogen bond was formed between the ARG40 and the hydroxyl group of the ligand. The other interactions were represented by alkyl and pi-alkyl bonds promoted by three amino acids and van der Walls interactions with four other amino acids. These results indicate an affinity between the ligand and the active site of the enzyme. Terpinen-4-ol is an interesting candidate for in vitro and in vivo assays to determine the potential for viral inhibition of SARS-CoV-2.
-
Número de páginas: 10
- Liliane Karine Cordeiro Braz
- Franklin Ferreira de Farias Nóbrega
- Rafael Trindade Maia
- LUANA CAMILLA CORDEIRO BRAZ
