La conversión de residuos agrícolas en bioetanol, requiere de hidrólisis enzimática, para conseguir una mayor degradación de carbohidratos vegetales en azúcares simples. Sin embargo, esta etapa aún necesita mayor investigación para alcanzar condiciones óptimas que permitan que la producción de bioetanol a escala comercial sea viable. En este sentido, se evaluó el efecto de la temperatura y carga enzimática en la hidrólisis enzimática de cáscara de piñón (Jatropha curcas) y pseudotallo de Musa x paradisiaca (Musa paradisiaca). Para este fin, se realizó el análisis proximal y elemental de la materia prima. Posteriormente se pretrató la biomasa con NaOH al 3% en relación 1:6 a 120 ºC y 1 atm de presión por 90 minutos. El hidrolizado químico fue sometido a hidrólisis enzimática, con celulasa de Aspergillus níger a un pH 5,2 por 120 horas de incubación. Se evaluó el efecto de la carga enzimática (5, 15 y 25 FPU/g sustrato) y la temperatura (27, 37 y 47ºC) en la concentración de azúcares reductores, a partir de un diseño factorial 32. Los resultados mostraron que a 47°C y cargas enzimáticas de 25 y 21,9 FPU/g biomasa para la cascara de Jatropha curcas y pseudotallo de Musa x paradisiaca, se alcanza el máximo rendimiento en azúcares reductores (2,431 ± 0,0067 y 3,0398 ± 0,099 g/l). La mayor concentración de bioetanol obtenida fue de 2,45 ml/l a partir de pseudotallo de Musa x paradisiaca y 2,36 ml/l para la cáscara de Jatropha curcas.