IDENTIFICATION OF BACTERIA PRESENT IN SEEDS OF Pinus engelmannii COLLECTED IN THE STATE OF DURANGO
La contaminación microbiológica en semillas de Pinus engelmannii es un problema que ocasiona serios problemas en la germinación de las semillas. El objetivo del presente trabajo fue identificar especies bacterianas presentes en semillas de esta especie, mediante el aislamiento de colonias desarrolladas alrededor de una muestra de semilla cultivada en medio agar QL. Se obtuvieron 30 colonias, las cuales fueron aisladas mediante resiembras periódicas, por lo que se pudo caracterizar morfológicamente por sus características macroscópicas y microscópicas, analizadas mediante la técnica de tinción de Gram. Posteriormente, se realizó una identificación molecular, mediante la del ADN genómico y una amplificación del gen 16s ribosomal, utilizando la técnica de PCR (Reacción en Cadena de la Polimerasa); así mismo, se realizó un análisis ARDRA (Análisis Amplificado de Restricción de ADNr), con el que fue posible establecer 11 distintos patrones de corte, de los cuales se pudieron identificar cepas permanecientes a la misma especie. Los productos de PCR fueron purificados y secuenciados, sin embargo, sólo fue posible identificar 13 muestras. Los resultados obtenidos de la secuenciación, indicaron la presencia de especies bacterianas como: Pseudomonas, Bacillus, Microccocus, Klebsiella, Acinetobacter y Serratia. Teniendo en cuenta el análisis ARDRA y la clasificación morfológica se otorgó identidad a bacterias que no fueron secuenciadas.
IDENTIFICATION OF BACTERIA PRESENT IN SEEDS OF Pinus engelmannii COLLECTED IN THE STATE OF DURANGO
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DOI: 10.22533/at.ed.3172152220077
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Palavras-chave: microorganismos, contaminación, semillas, PCR
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Keywords: microorganisms, pollution, seeds, PCR
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Abstract:
Microbiological contamination in Pinus engelmannii seeds is a problem that causes serious problems in seed germination. The goal of this work was to identify bacterial species present in seeds of this species, by isolating colonies developed around a seed sample grown in QL agar medium. Thirty colonies were obtained, which were isolated by periodic reseeding, so they could be morphologically characterized by their macroscopic and microscopic characteristics, analyzed by Gram stain technique. Subsequently, a molecular identification was carried out, by means of genomic DNA and an amplification of the 16s ribosomal gene, using the PCR (Polymerase Chain Reaction) technique; likewise, an ARDRA analysis (Amplified Restriction Analysis of rDNA) was carried out, with which it was possible to establish 11 different cutting patterns, of which strains remaining to the same species could be identified. The PCR products were purified and sequenced, however only 13 samples could be identified. The results obtained from the sequencing indicated the presence of bacterial species such as: Pseudomonas, Bacillus, Microccocus, Klebsiella, Acinetobacter and Serratia. Taking into account the ARDRA analysis and the morphological classification, identity was granted to bacteria that were not sequenced.
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Número de páginas: 13
- Melissa Bocanegra-Salazar
- Juan Antonio Rojas-Contreras
- Jorge Armando Chávez-Simental
- Dyada Blanca León-Flores
- Eusebio Montiel-Antuna
- Georgina Ixtaccihuatl Ojeda-Mijares
- MARÍA ANGÉLICA MARTELL NEVÁREZ
