ESTRUTURA GENÉTICA DE MANDIOCAS CULTIVADAS NA AMAZÔNIA NORTE MATO-GROSSENSE
Os marcadores genéticos têm aplicação importante na caracterização da diversidade dos recursos genéticos, pois permitem quantificar a diversidade genética, estimar a endogamia e caracterizar novas espécies. Portanto, o objetivo deste estudo foi avaliar a estrutura genética de etnovariedades de mandioca cultivadas no município de Alta Floresta, MT, por meio de marcadores microssatélites. Um total de 29 etnovariedades de mandioca foram coletadas. A extração do DNA seguiu protocolo de CTAB. As reações de amplificação foram realizadas com 15 primers SSR marcados com fluorescência. Os dados obtidos foram analisados pelo programa Structure e GenAIEx. O número mais provável de grupos que contribuíram para a composição genética dos cultivos de mandioca foi verificado pelo ∆K, indicando a formação de dois grupos genéticos distintos entre as etnovariedades. A análise de variância molecular (AMOVA) revelou 99% de variação dentro dos grupos obtidos com a análise do Structure (K1 e K2). A baixa variação entre os grupos (1%) também ser confirmada pelo Fst, com valor de 0,009. A análise de Coordenadas Principais (PCoA) contribuiu com os resultados encontrados na análise de estrutura populacional. A PCoA1 explicou 8,13% da variação genética, seguido da PCoA2 com 6,38%. Juntas explicaram 14,51% da variação genética. As etnovariedades de mandioca cultivadas no município de Alta Floresta, Mato Grosso apresentam estruturação genética. Há variabilidade genética intragrupos, indicando que as etnovariedades cultivadas em roças constituem uma forma de recurso genético que deve ser conservada, pois apresentam potencial para serem utilizadas em programas de melhoramento.
ESTRUTURA GENÉTICA DE MANDIOCAS CULTIVADAS NA AMAZÔNIA NORTE MATO-GROSSENSE
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DOI: 10.22533/at.ed.25720160114
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Palavras-chave: Manihot esculenta; Microssatélites; Recursos genéticos
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Keywords: Manihot esculenta, Microsatellites, Genetic Resources
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Abstract:
The genetic markers have important application for characterization of the genetic resources diversity. They are used for estimation genetic diversity, inbreeding and characterization of new species. In this study, we analyzed the genetic structure of cassava landraces that are cultivated in Alta Floresta, Mato Grosso State (MT). We collected 29 landraces. The DNA extraction followed CTAB protocol. The amplification reaction were performed using 15 SSR primers labeled by fluorescence. Date were analyzed using Structure and GenAIEx programs. The landraces were clustered into two genetic group, such as it was indicated by ∆K (the more probable number of groups). The analysis of molecular variance (AMOVA) revealed 99% of variation are within groups (K1 e K2), which were obtained by analysis of Structure. The low variation between groups (1%) was supported by Fst (0.009). The principal coordinates analysis (PCoA) contributed with findings in population structure analysis. The PCoA1 and PCoA2 explicated 8.13% and 6.38% of the genetic variation, respectively; they together explicated 14.51% of the genetic variation. The cassava landraces, that are cultivated in Alta Floresta, MT, have genetic structure. There is genetic variability intragroup, thus the landraces, which grown on farms, are a kind genetic resources that should be conserved because they have potential for use in breeding program.
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Número de páginas: 14
- Ana Aparecida Bandini Rossi
- Eliane Cristina Moreno de Pedri
- Fernando Saragosa Rossi
- Vinicius Delgado da Rocha
- Joameson Antunes Lima
- Eulalia Soler Sobreira Hoogerheide
- Larissa Lemes dos Santos
- Elisa dos Santos Cardoso
- Sérgio Alessandro Machado Souza
- Auana Vicente Tiago
